Es un organismo descentralizado, no sectorizado, con personalidad jurídica y patrimonio propio, con autonomía técnica y de gestión, mismo que tendrá su sede en la capital del Estado. Contará con una estructura operativa para la realización de sus atribuciones, objetivos y fines, y por lo tanto, el Congreso del Estado deberá asignarle el presupuesto suficiente para el ejercicio integral de sus funciones (artículo 24 de la Ley del Sistema Anticorrupción del Estado de Morelos).
Objeto
La Secretaría Ejecutiva tiene por objeto fungir como órgano de apoyo técnico, enlace, gestión y operación del Comité Coordinador del Sistema Estatal Anticorrupción, a efecto de administrar y proveerle asistencia técnica, jurídica y especializada, así como los insumos necesarios para el desempeño de sus funciones y atribuciones (artículos 25 de la Ley del Sistema Anticorrupción del Estado de Morelos y 5 del Estatuto Orgánico de la Secretaría Ejecutiva del Sistema Estatal Anticorrupción).